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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
Commit message (Expand)AuthorAge
* gnu: jamm: Use G-expression.Ricardo Wurmus2023-05-12
* gnu: arriba: Use SEARCH-INPUT-FILE and -DIRECTORY.Ricardo Wurmus2023-05-12
* gnu: multichoose: Clean up.Ricardo Wurmus2023-05-12
* gnu: samblaster: Update to 0.1.26.Ricardo Wurmus2023-05-12
* gnu: samblaster: Simplify.Ricardo Wurmus2023-05-12
* gnu: methyldackel: Update to 0.6.1.Ricardo Wurmus2023-05-12
* gnu: methyldackel: Simplify arguments.Ricardo Wurmus2023-05-12
* gnu: phast: Simplify by using G-expression.Ricardo Wurmus2023-05-12
* gnu: ribotaper: Simplify with G-expression.Ricardo Wurmus2023-05-12
* gnu: sra-tools: Do link with libxml2.Ricardo Wurmus2023-05-12
* gnu: ncbi-vdb: Ensure that vdb-sqlite is installed.Ricardo Wurmus2023-05-12
* gnu: Add python-mgatk.Mădălin Ionel Patrașcu2023-05-12
* gnu: Add homer.Ricardo Wurmus2023-05-08
* Revert "gnu: Add python-gimmemotifs."Ricardo Wurmus2023-05-05
* gnu: Add python-gimmemotifs.Ricardo Wurmus2023-05-05
* gnu: Add python-biofluff.Ricardo Wurmus2023-05-05
* gnu: Add python-genomepy.Ricardo Wurmus2023-05-05
* gnu: Add python-logomaker.Ricardo Wurmus2023-05-05
* gnu: python-pyfaidx: Update to 0.7.2.1.Ricardo Wurmus2023-05-05
* gnu: python-screed: Update to 1.1.2.Mădălin Ionel Patrașcu2023-05-04
* gnu: Add python-goatools.Navid Afkhami2023-05-04
* gnu: pigx-sars-cov-2: Update to 0.0.9.Ricardo Wurmus2023-05-03
* gnu: Add fanc.Ricardo Wurmus2023-05-03
* gnu: r-tictoc: Update to 1.2.Ricardo Wurmus2023-04-29
* gnu: gdcm: Disable dependent tests.Ricardo Wurmus2023-04-27
* gnu: freebayes: Update to 1.3.7.Ricardo Wurmus2023-04-27
* gnu: vcflib: Use libwfa2.pc.Ricardo Wurmus2023-04-27
* gnu: wfa2-lib: Install pkg-config file.Ricardo Wurmus2023-04-27
* gnu: express: Adjust bamtools location.Ricardo Wurmus2023-04-27
* gnu: python-dendropy: Fix build.Ricardo Wurmus2023-04-26
* gnu: cwltool: Use pyproject-build-system.Ricardo Wurmus2023-04-25
* gnu: python-schema-salad: Use pyproject-build-system.Ricardo Wurmus2023-04-25
* gnu: adapterremoval: Update to 2.3.3.Ricardo Wurmus2023-04-25
* gnu: bedtools-2.18: Fix build.Ricardo Wurmus2023-04-25
* gnu: hisat: Build with GCC 10.Ricardo Wurmus2023-04-25
* gnu: kallisto: Update to 0.48.0.Ricardo Wurmus2023-04-25
* gnu: bpp-core: Build with GCC 10.Ricardo Wurmus2023-04-25
* gnu: vcflib: Update to 1.0.9.Ricardo Wurmus2023-04-25
* gnu: tabixpp: Update to 1.1.2.Ricardo Wurmus2023-04-25
* gnu: Add wfa2-lib.Ricardo Wurmus2023-04-25
* gnu: lofreq: Set file timestamps to 1980s.Ricardo Wurmus2023-04-25
* gnu: lofreq: Drop input labels.Ricardo Wurmus2023-04-25
* gnu: ivar: Update to 1.4.2.Ricardo Wurmus2023-04-25
* gnu: multiqc: Update to 1.14.Ricardo Wurmus2023-04-24
* gnu: macs: Patch version check for Python.Ricardo Wurmus2023-04-24
* gnu: salmon: Update to 1.10.1.Ricardo Wurmus2023-04-24
* gnu: Add htscodecs.Ricardo Wurmus2023-04-24
* Merge remote-tracking branch 'origin/master' into core-updatesAndreas Enge2023-04-22
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| * gnu: bppsuite: Update to 2.4.1.Mădălin Ionel Patrașcu2023-04-21
| * gnu: bpp-popgen: Update to 2.4.1.Mădălin Ionel Patrașcu2023-04-21