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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
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* gnu: Add r-gg3d.Ricardo Wurmus2023-01-09
* gnu: Move Java XML packages to new module.Ricardo Wurmus2023-01-08
* gnu: Add gdcm.Antero Mejr2023-01-08
* gnu: Use old setuptools in packages that relies on use_2to3 conversion.Marius Bakke2023-01-07
* gnu: bbmap: Update to 39.01.Ricardo Wurmus2023-01-06
* gnu: bbmap: Use gexp.Ricardo Wurmus2023-01-06
* gnu: nanopolish: Drop input labels.Ricardo Wurmus2023-01-06
* gnu: nanopolish: Update to 0.14.0.Ricardo Wurmus2023-01-06
* gnu: filtlong: Use Python 3.Ricardo Wurmus2023-01-06
* gnu: filtlong: Use gexp.Ricardo Wurmus2023-01-06
* gnu: filtlong: Drop input labels.Ricardo Wurmus2023-01-06
* gnu: filtlong: Remove trailing #T from build phases.Ricardo Wurmus2023-01-06
* gnu: ngless: Use gexp.Ricardo Wurmus2023-01-06
* gnu: ngless: Remove trailing #T from build phases.Ricardo Wurmus2023-01-06
* gnu: bamtools: Build shared libraries.Ricardo Wurmus2023-01-04
* gnu: Add scallop.Ricardo Wurmus2023-01-04
* gnu: Add python-bcbio-gff.Ricardo Wurmus2023-01-03
* gnu: Add r-domultibarheatmap.Ricardo Wurmus2022-12-30
* gnu: r-giotto: Update to 1.1.2-1.3c8067c.Ricardo Wurmus2022-12-28
* gnu: Add r-bedtorch.Ricardo Wurmus2022-12-22
* gnu: Add r-rhtslib12.Ricardo Wurmus2022-12-22
* gnu: Add wiggletools.Ricardo Wurmus2022-12-22
* gnu: Add python-episcanpy.Navid Afkhami2022-12-22
* gnu: Add python-bamnostic.Navid Afkhami2022-12-22
* gnu: Add vembrane.Ricardo Wurmus2022-12-21
* gnu: python-plastid: Update to 0.6.0.Ricardo Wurmus2022-12-21
* gnu: python-pysam: Update to 0.20.0.Ricardo Wurmus2022-12-21
* gnu: htslib: Update to 1.16.Ricardo Wurmus2022-12-21
* gnu: pbbam: Use htslib 1.14.Ricardo Wurmus2022-12-21
* gnu: Add htslib-1.14.Ricardo Wurmus2022-12-21
* gnu: python-scanpy: Use pyproject-build-system.Ricardo Wurmus2022-12-18
* gnu: python-multivelo: Simplify with pyproject-build-system.Ricardo Wurmus2022-12-18
* gnu: bedtools-2.18: Use gexp.Ricardo Wurmus2022-12-14
* gnu: bedops: Update to 2.4.41.Ricardo Wurmus2022-12-13
* gnu: tophat: Remove trailing #T from build phases and snippet.Ricardo Wurmus2022-12-13
* gnu: python-bx-python: Update to 0.9.0.Ricardo Wurmus2022-12-13
* gnu: bioawk: Use gexp.Ricardo Wurmus2022-12-13
* gnu: blasr-libcpp: Remove trailing #T from build phases.Ricardo Wurmus2022-12-13
* gnu: pbbam: Drop input labels.Ricardo Wurmus2022-12-13
* gnu: pbbam: Update to 2.1.0.Ricardo Wurmus2022-12-13
* gnu: pbcopper: Update to 2.0.0.Ricardo Wurmus2022-12-13
* gnu: bedtools: Remove unnecessary quasiquotation.Ricardo Wurmus2022-12-13
* gnu: bamutils: Update to 1.0.15.Ricardo Wurmus2022-12-13
* gnu: bamtools: Update to 2.5.2.Ricardo Wurmus2022-12-13
* gnu: aragorn: Update to 1.2.41.Ricardo Wurmus2022-12-13
* gnu: cnvkit: Update to 0.9.9.Ricardo Wurmus2022-12-13
* gnu: seqmagick: Update to 0.8.4.Ricardo Wurmus2022-12-13
* gnu: python-cgatcore: Update to 0.6.14.Ricardo Wurmus2022-12-13
* gnu: python-dna-features-viewer: Update to 3.1.1.Ricardo Wurmus2022-12-13
* gnu: python-hicexplorer: Update to 3.7.2.Ricardo Wurmus2022-12-13