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| * gnu: muscle: Use INVOKE.Ricardo Wurmus2018-11-08
| * gnu: newick-utils: Remove custom autoconf phase.Ricardo Wurmus2018-11-08
| * gnu: mash: Remove custom autoconf phase.Ricardo Wurmus2018-11-08
| * gnu: vsearch: Remove custom autogen phase.Ricardo Wurmus2018-11-08
| * gnu: java-picard-1.113: Use INVOKE.Ricardo Wurmus2018-11-08
| * gnu: fraggenescan: Use INVOKE.Ricardo Wurmus2018-11-08
| * gnu: sailfish: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-08
| * gnu: ngs-sdk: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-08
| * gnu: ncbi-vdb: Use INVOKE and end phases on #T.Ricardo Wurmus2018-11-08
| * gnu: ncbi-vdb: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-08
| * gnu: tadbit: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-08
| * gnu: pspp: Update to 1.2.0.Kei Kebreau2018-11-07
| * gnu: Add spread-sheet-widget.Kei Kebreau2018-11-07
| * gnu: filevercmp: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: ritornello: Update to 2.0.1.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: ritornello: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: snap-aligner: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: sortmerna: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: vsearch: Fetch source from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: preseq: Update to 2.0.3.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: preseq: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: seqtk: Update to 1.3.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: seqtk: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: raxml: Update to 8.2.12.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: python2-biom-format: Fix build.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: raxml: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: pyicoteo: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: hplip: Remove bundled non-free blobs.Efraim Flashner2018-11-07
| * gnu: sra-tools: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: libgff: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: kentutils: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: r-seqgl: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: pplacer: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: minced: Update to 0.3.2.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: minced: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: metabat: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: mash: Update to 2.1.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: mash: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* | Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke2018-11-07
|\|
| * gnu: fio: Update to 3.11.Marius Bakke2018-11-07
| * gnu: kaiju: Update to 1.6.3.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: kaiju: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: idr: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: java-htsjdk: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: hisat2: Use versioned source URL.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: grit: Update to 2.0.5.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: grit: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: gemma: Update to 0.98.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: gemma: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
| * gnu: clementine: Build with sqlite-with-column-metadata.Pierre Langlois2018-11-07