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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
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* gnu: bioperl-minimal: Remove trailing #T from build phase.Ricardo Wurmus2022-12-12
* gnu: python-biom-format: Update to 2.1.12.Ricardo Wurmus2022-12-02
* gnu: Add python-scikit-bio.Ricardo Wurmus2022-12-02
* gnu: python-pairtools: Update to 1.0.2.Ricardo Wurmus2022-12-02
* gnu: python-pairtools: Run tests conditionally.Ricardo Wurmus2022-12-02
* gnu: python-pybedtools: Use pyproject-build-system.Ricardo Wurmus2022-12-02
* gnu: python-htsget: Update to 0.2.6.Ricardo Wurmus2022-12-02
* gnu: python-cellbender: Update to 0.2.2.Ricardo Wurmus2022-12-02
* gnu: Add python-fanc.Ricardo Wurmus2022-12-02
* gnu: Add python-genomic-regions.Ricardo Wurmus2022-12-02
* gnu: Add r-btools.Navid Afkhami2022-11-25
* gnu: r-circus: Update to 0.1.7.Ricardo Wurmus2022-11-17
* gnu: Add r-disgenet2r.Ricardo Wurmus2022-11-15
* gnu: Add r-pando.Mădălin Ionel Patrașcu2022-11-09
* gnu: Add python-cooltools.Mădălin Ionel Patrașcu2022-11-04
* gnu: Add python-bioframe.Mădălin Ionel Patrașcu2022-11-04
* gnu: r-dyngen: Update to 1.0.5.Ricardo Wurmus2022-11-04
* gnu: Fix various lint issues in synopsis and descriptions.Vagrant Cascadian2022-10-31
* gnu: flair: Update to 1.6.4.Ricardo Wurmus2022-10-28
* gnu: flair: Set R_HOME.Ricardo Wurmus2022-10-28
* gnu: flair: Add missing R package.Ricardo Wurmus2022-10-28
* gnu: flair: Add missing R packages.Ricardo Wurmus2022-10-27
* gnu: Add python-multivelo.Mădălin Ionel Patrașcu2022-10-27
* gnu: Add r-seuratwrappers.Hong.Li@mdc-berlin.de2022-10-27
* gnu: Various typo fixes.Vagrant Cascadian2022-10-24
* gnu: Fix typos.Vagrant Cascadian2022-10-23
* gnu: pigx-sars-cov-2: Update to 0.0.8.Ricardo Wurmus2022-10-08
* gnu: plink: Change origin URL.Christopher Baines2022-10-06
* gnu: Add megahit.Ricardo Wurmus2022-10-05
* gnu: Add cd-hit-auxtools.Ricardo Wurmus2022-10-05
* gnu: cd-hit: Update to 4.8.1.Ricardo Wurmus2022-10-05
* gnu: kaiju: Update to 1.9.0.Ricardo Wurmus2022-10-04
* gnu: salmon: Update to 1.9.0.Ricardo Wurmus2022-09-30
* gnu: Add centrifuge.Ricardo Wurmus2022-09-30
* gnu: blast+: Build reproducibly.Ricardo Wurmus2022-09-29
* gnu: Add r-compgenomrdata.Ricardo Wurmus2022-09-26
* gnu: Add mudskipper.Ricardo Wurmus2022-09-23
* gnu: python-cooler: Skip broken test.Ricardo Wurmus2022-09-21
* gnu: python-cooler: Do not use flake8.Ricardo Wurmus2022-09-21
* gnu: Add r-chromunity.Ricardo Wurmus2022-09-21
* gnu: Add r-skitools.Ricardo Wurmus2022-09-21
* gnu: Add r-gchain.Ricardo Wurmus2022-09-21
* gnu: Add r-gtrack.Ricardo Wurmus2022-09-21
* gnu: Add r-bamutils.Ricardo Wurmus2022-09-21
* gnu: Add r-gutils.Ricardo Wurmus2022-09-21
* gnu: python-pyvcf: Update to 0.6.8-0.476169c.Ricardo Wurmus2022-09-20
* gnu: python-pyvcf: Use older setuptools.Ricardo Wurmus2022-09-20
* gnu: catch-framework2: Rename variable to catch2.Maxim Cournoyer2022-09-15
* gnu: kraken2: Update to 2.1.2.Ricardo Wurmus2022-09-13
* gnu: Add comments to the bottom of a few package modules.Christopher Baines2022-09-10