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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
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* gnu: All snippets report errors using exceptions, else return #t.Mark H Weaver2018-03-16
* gnu: kentutils: Build with mariadb.Ricardo Wurmus2018-03-16
* Merge branch 'master' into core-updatesRicardo Wurmus2018-03-14
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| * gnu: Add pigx-bsseq.Ricardo Wurmus2018-03-11
| * gnu: Add pigx-chipseq.Ricardo Wurmus2018-03-11
| * gnu: r-rhdf5lib: Make build reproducible.Ricardo Wurmus2018-03-09
| * gnu: Add r-phangorn.Ricardo Wurmus2018-03-08
| * gnu: r-ape: Move to (gnu packages cran).Ricardo Wurmus2018-03-08
| * gnu: r-dropbead: Update to 0-2.d746c6f.Ricardo Wurmus2018-03-08
| * gnu: Add pigx-rnaseq.Ricardo Wurmus2018-03-07
| * gnu: samtools: Update to 1.7.Ricardo Wurmus2018-03-06
| * gnu: htslib: Update to 1.7.Ricardo Wurmus2018-03-06
| * gnu: r-rhdf5: Make build reproducible.Ricardo Wurmus2018-03-06
| * gnu: piranha: Declare a source file-name.Efraim Flashner2018-03-04
| * gnu: libdivsufsort: Declare a source file-name.Efraim Flashner2018-03-04
| * gnu: seek: Declare a source file-name.Efraim Flashner2018-03-04
| * gnu: r-dropbead: Declare a source file-name.Efraim Flashner2018-03-04
| * gnu: Add dropseq-tools.Ricardo Wurmus2018-03-03
| * gnu: Add java-picard-2.10.3.Ricardo Wurmus2018-03-03
| * gnu: Add java-htsjdk-2.10.1.Ricardo Wurmus2018-03-03
| * gnu: Add java-htsjdk-latest.Ricardo Wurmus2018-03-03
| * gnu: Add java-biojava-alignment-4.0.Ricardo Wurmus2018-03-03
| * gnu: Add java-biojava-phylo-4.0.Ricardo Wurmus2018-03-03
| * gnu: Add java-biojava-core-4.0.Ricardo Wurmus2018-03-03
| * gnu: Add java-biojava-alignment.Ricardo Wurmus2018-03-03
| * gnu: Add java-biojava-phylo.Ricardo Wurmus2018-03-03
| * gnu: Add java-forester-1.005.Ricardo Wurmus2018-03-03
| * gnu: Add java-forester.Ricardo Wurmus2018-03-03
| * gnu: Add java-biojava-core.Ricardo Wurmus2018-03-03
| * gnu: Add fastqc.Ricardo Wurmus2018-03-03
| * gnu: cutadapt: Update to 1.16.Ricardo Wurmus2018-03-02
| * gnu: r-scran: Update to 1.6.8.Ricardo Wurmus2018-03-01
| * gnu: r-wgcna: Update to 1.63.Ricardo Wurmus2018-03-01
| * gnu: r-topgo: Update to 2.30.1.Ricardo Wurmus2018-03-01
| * gnu: r-genomicranges: Update to 1.30.3.Ricardo Wurmus2018-03-01
| * gnu: r-limma: Update to 3.34.9.Ricardo Wurmus2018-03-01
| * gnu: r-edger: Update to 3.20.9.Ricardo Wurmus2018-03-01
| * gnu: r-shortread: Update to 1.36.1.Ricardo Wurmus2018-03-01
| * gnu: r-dexseq: Update to 1.24.3.Ricardo Wurmus2018-03-01
* | build-system/gnu: Add 'bootstrap' phase.Ludovic Courtès2018-03-11
|/
* gnu: r-qtl: Update to 1.42-8.Ricardo Wurmus2018-02-22
* gnu: r-delayedmatrixstats: Update to 1.0.3.Ricardo Wurmus2018-02-19
* gnu: r-scater: Update to 1.6.3.Ricardo Wurmus2018-02-19
* gnu: r-gviz: Update to 1.22.3.Ricardo Wurmus2018-02-19
* gnu: r-gprofiler: Update to 0.6.4.Ricardo Wurmus2018-02-19
* gnu: r-ensembldb: Update to 2.2.2.Ricardo Wurmus2018-02-19
* gnu: r-seurat: Update to 2.2.1.Ricardo Wurmus2018-02-19
* gnu: r-qtl: Update to 1.42-7.Ricardo Wurmus2018-02-19
* gnu: r-genomicranges: Update to 1.30.2.Ricardo Wurmus2018-02-19
* gnu: r-getopt: Update to 1.20.2.Ricardo Wurmus2018-02-19