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* Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke2020-03-14
|\
| * gnu: edirect: Update to 13.3.20200128.Efraim Flashner2020-03-12
| * gnu: r-qtl: Update to 1.46-2.Ricardo Wurmus2020-03-12
| * gnu: python-pybedtools: Update to 0.8.1.Efraim Flashner2020-03-11
| * gnu: python-pyfaidx: Update to 0.5.8.Efraim Flashner2020-03-11
| * gnu: Add python2-pyfaidx.Efraim Flashner2020-03-11
| * gnu: java-forester-1.005: Update source URI.Björn Höfling2020-03-10
* | gnu: salmon: Adjust for C_INCLUDE_PATH changes.Marius Bakke2020-03-13
|/
* gnu: Fix build of python-velocyto.Roel Janssen2020-03-09
* gnu: ngless: Update to 1.1.0.Ricardo Wurmus2020-03-08
* gnu: taxtastic: Update to 0.8.11.Ricardo Wurmus2020-03-08
* gnu: r-methylkit: Add r-knitr.Ricardo Wurmus2020-03-07
* gnu: r-vsn: Add r-knitr.Ricardo Wurmus2020-03-07
* gnu: python-scanpy: Update to 1.4.5.1.Ricardo Wurmus2020-03-06
* gnu: gess: Use WRAP-SCRIPT.Ricardo Wurmus2020-03-03
* gnu: gess: Override PYTHONPATH.Ricardo Wurmus2020-03-03
* gnu: r-seqminer: Update to 8.0.Ricardo Wurmus2020-03-02
* gnu: r-hdf5array: Update to 1.14.3.Ricardo Wurmus2020-03-01
* gnu: r-rsamtools: Update to 2.2.3.Ricardo Wurmus2020-03-01
* gnu: r-edger: Update to 3.28.1.Ricardo Wurmus2020-03-01
* gnu: r-seurat: Update to 3.1.4.Ricardo Wurmus2020-03-01
* gnu: infernal: Update to 1.1.3.Ricardo Wurmus2020-02-27
* gnu: vcftools: Update to 0.1.16.Ricardo Wurmus2020-02-27
* gnu: bedtools: Update to 2.29.2.Ricardo Wurmus2020-02-27
* gnu: rseqc: Update to 3.0.1.Ricardo Wurmus2020-02-27
* gnu: proteinortho: Update to 6.0.14.Ricardo Wurmus2020-02-26
* gnu: diamond: Update to 0.9.30.Ricardo Wurmus2020-02-26
* gnu: crossmap: Update to 0.3.8.Ricardo Wurmus2020-02-26
* gnu: macs: Update to 2.2.6.Ricardo Wurmus2020-02-26
* gnu: Remove python-loompy-for-pigx-scrnaseq.Ricardo Wurmus2020-02-26
* gnu: pigx-scrnaseq: Update to 1.1.3.Ricardo Wurmus2020-02-26
* gnu: jamm: Update to 1.0.7.6.Ricardo Wurmus2020-02-25
* gnu: r-scran: Update to 1.14.6.Ricardo Wurmus2020-02-19
* gnu: r-hdf5array: Update to 1.14.2.Ricardo Wurmus2020-02-19
* gnu: r-gviz: Update to 1.30.3.Ricardo Wurmus2020-02-19
* gnu: r-rhtslib: Update to 1.18.1.Ricardo Wurmus2020-02-19
* gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.38.2.Ricardo Wurmus2020-02-19
* gnu: r-rsamtools: Update to 2.2.2.Ricardo Wurmus2020-02-19
* gnu: r-limma: Update to 3.42.2.Ricardo Wurmus2020-02-19
* gnu: r-shortread: Update to 1.44.3.Ricardo Wurmus2020-02-19
* gnu: r-seurat: Update to 3.1.3.Ricardo Wurmus2020-02-19
* gnu: r-qtl: Update to 1.45-11.Ricardo Wurmus2020-02-19
* gn: edirect: Update to 12.1.20190829.Efraim Flashner2020-02-18
* gnu: python2-pbcore: Remove python2-sphinx dependency.Marius Bakke2020-02-13
* gnu: r-gviz: Update to 1.30.1.Ricardo Wurmus2020-01-27
* gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.38.1.Ricardo Wurmus2020-01-27
* gnu: r-s4vectors: Update to 0.24.3.Ricardo Wurmus2020-01-27
* gnu: r-diversitree: Update to 0.9-13.Ricardo Wurmus2020-01-27
* gnu: ocaml: Switch to ocaml 4.09 by default.Julien Lepiller2020-01-27
* gnu: Use HTTPS for (gnu packages bioinformatics) home pages.Tobias Geerinckx-Rice2020-01-21