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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
Commit message (Expand)AuthorAge
* gnu: r-seqinr: Update to 3.3-6.Ricardo Wurmus2017-04-06
* gnu: r-rcpparmadillo: Update to 0.7.700.0.0.Ricardo Wurmus2017-04-06
* gnu: r-annotationforge: Update to 1.16.1.Ricardo Wurmus2017-04-06
* gnu: r-shortread: Update to 1.32.1.Ricardo Wurmus2017-04-06
* gnu: r-s4vectors: Update to 0.12.2.Ricardo Wurmus2017-04-06
* gnu: r-iranges: Update to 2.8.2.Ricardo Wurmus2017-04-06
* gnu: r-variantannotation: Update to 1.20.3.Ricardo Wurmus2017-04-06
* gnu: r-limma: Update to 3.30.13.Ricardo Wurmus2017-04-06
* gnu: r-genomicranges: Update to 1.26.4.Ricardo Wurmus2017-04-06
* gnu: r-annotationdbi: Update to 1.36.2.Ricardo Wurmus2017-04-06
* gnu: r-genomicalignments: Update to 1.10.1.Ricardo Wurmus2017-04-06
* gnu: r-rtracklayer: Update to 1.34.2.Ricardo Wurmus2017-04-06
* gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.26.4.Ricardo Wurmus2017-04-06
* gnu: r-seqminer: Update to 5.7.Ricardo Wurmus2017-04-06
* gnu: r-maldiquant: Update to 1.16.2.Ricardo Wurmus2017-04-06
* gnu: r-genomeinfodb: Update to 1.10.3.Ricardo Wurmus2017-04-06
* gnu: r-xvector: Update to 0.14.1.Ricardo Wurmus2017-04-06
* gnu: r-bioccheck: Update to 1.10.1.Ricardo Wurmus2017-04-06
* gnu: sra-tools: Fix glibc naming conflict.Ricardo Wurmus2017-04-05
* gnu: sra-tools: Use "modify-phases" syntax.Ricardo Wurmus2017-04-05
* gnu: diamond: Update to 0.8.37.Ben Woodcroft2017-04-05
* gnu: Use HTTPS URLs for GitHub home-pages.Leo Famulari2017-04-02
* gnu: khmer: Build with gcc-4.Ben Woodcroft2017-04-02
* Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke2017-03-30
|\
| * Replace (compose not PROC) with simpler idioms.Ludovic Courtès2017-03-28
* | gnu: discrover: Add missing includes.Ricardo Wurmus2017-03-30
* | gnu: stringtie: Remove typedef conflict.Ricardo Wurmus2017-03-30
|/
* gnu: star: Update to 2.5.3a.Ricardo Wurmus2017-03-23
* gnu: python-pysam: Run tests in parallel.Ricardo Wurmus2017-03-22
* gnu: python-pysam: Run tests before installation.Ricardo Wurmus2017-03-22
* gnu: python-pysam: Update to 0.10.0.Ricardo Wurmus2017-03-22
* gnu: Rename "guile-next" to "guile".Ludovic Courtès2017-03-19
* gnu: r: Rename to r-minimal.Ricardo Wurmus2017-03-17
* gnu: r: Do not build recommended packages.Ricardo Wurmus2017-03-17
* gnu: Add r-seurat.Raoul Jean Pierre Bonnal2017-03-16
* gnu: sra-tools: Update to 2.8.2-1.Ricardo Wurmus2017-03-16
* gnu: ncbi-vdb: Install configuration files.Ricardo Wurmus2017-03-16
* gnu: ncbi-vdb: Override search path for java-ngs.Ricardo Wurmus2017-03-16
* gnu: ncbi-vdb: Use modify-phases syntax.Ricardo Wurmus2017-03-16
* gnu: ncbi-vdb: Update to 2.8.2.Ricardo Wurmus2017-03-16
* gnu: ngs-sdk: Update to 1.3.0.Ricardo Wurmus2017-03-16
* gnu: Use INSTALL-FILE where appropriate.Tobias Geerinckx-Rice2017-03-15
* gnu: samtools: End installation phases with truth.Tobias Geerinckx-Rice2017-03-15
* gnu: vsearch: Update to 2.4.2.Ben Woodcroft2017-03-11
* gnu: Add r-ape.Raoul Jean Pierre Bonnal2017-03-11
* gnu: hmmer: Build reproducibly.Ben J. Woodcroft2017-03-10
* gnu: Add sambamba.Ricardo Wurmus2017-03-10
* Merge branch 'python-tests'Marius Bakke2017-03-03
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| * gnu: ribodiff: Fix test failure.Marius Bakke2017-02-27
| * gnu: python-dendropy: Fix failing tests.Ricardo Wurmus2017-02-24