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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
Commit message (Expand)AuthorAge
* Merge branch 'master' into core-updatesLudovic Courtès2015-09-13
|\
| * gnu: Add deeptools.Ricardo Wurmus2015-09-02
* | gnu: Use 'install-file' instead of 'mkdir-p' and 'copy-file' in obvious cases.Ludovic Courtès2015-08-29
|/
* gnu: Add BioPerl.Ricardo Wurmus2015-08-26
* gnu: shogun: Move package to machine-learning.scm.Ricardo Wurmus2015-08-14
* gnu: bedtools: Add patch to fix compilation on 32 bit systems.Ben Woodcroft2015-07-25
* gnu: bedtools: Update to 2.24.0.Ben Woodcroft2015-07-25
* gnu: Add aragorn.Ben Woodcroft2015-07-21
* gnu: metabat: Minor tweaks.Mark H Weaver2015-07-19
* gnu: Add metabat.Ben Woodcroft2015-07-19
* gnu: preseq: Move "use-samtools-headers" phase.Ricardo Wurmus2015-07-09
* gnu: Add preseq.Ricardo Wurmus2015-07-08
* gnu: samtools: Install headers.Ricardo Wurmus2015-07-08
* gnu: samtools: Update to 1.2.Ricardo Wurmus2015-07-07
* gnu: Add prodigal.Ben Woodcroft2015-07-05
* gnu: shogun: Build with install RPATH.Ricardo Wurmus2015-07-04
* gnu: Add WarpedLMM.Ricardo Wurmus2015-07-02
* gnu: Add Blast+.Ricardo Wurmus2015-06-29
* gnu: Add plink.Ricardo Wurmus2015-06-29
* gnu: Add hmmer.Ben Woodcroft2015-06-24
* gnu: star: Update to 2.4.2a.Ricardo Wurmus2015-06-23
* gnu: miso: Install executables.Ricardo Wurmus2015-06-23
* gnu: Add idr.Ricardo Wurmus2015-06-23
* gnu: Add fasttree.Ben Woodcroft2015-06-21
* gnu: Add diamond.Ben Woodcroft2015-06-17
* gnu: miso: Use HTTPS URL.Ricardo Wurmus2015-06-17
* gnu: bedops: Update to 2.4.14.Ricardo Wurmus2015-06-17
* gnu: orfm: Update to 0.4.1.Ricardo Wurmus2015-06-15
* gnu: Add OrfM.Ben Woodcroft2015-06-12
* gnu: Add Couger.Ricardo Wurmus2015-06-12
* gnu: ngs-sdk: Update to version 1.1.1.Ricardo Wurmus2015-06-12
* gnu: Add HTSlib.Ricardo Wurmus2015-06-02
* gnu: ncbi-vdb: Use "i386" instead of "i686" in directory name.Ricardo Wurmus2015-06-02
* gnu: Add edirect.Ricardo Wurmus2015-05-27
* gnu: shogun: Remove non-free source files.Ricardo Wurmus2015-05-27
* gnu: Add rsem.Ricardo Wurmus2015-05-22
* gnu: vcftools: Remove "-m64" from CFLAGS.Ricardo Wurmus2015-05-05
* gnu: bamtools: Set rpath via LDFLAGS.Ricardo Wurmus2015-05-04
* gnu: Add samtools-0.1.19.Ricardo Wurmus2015-05-04
* gnu: samtools: Install libbam.a library.Ricardo Wurmus2015-05-04
* gnu: samtools: Remove patch-makefile-curses phase.Ricardo Wurmus2015-05-04
* gnu: flexbar: Enable tests.Ricardo Wurmus2015-04-27
* gnu: Add eXpress.Ricardo Wurmus2015-04-21
* gnu: Add bamtools.Ricardo Wurmus2015-04-21
* gnu: Add subread.Ricardo Wurmus2015-04-21
* gnu: Add sra-tools.Ricardo Wurmus2015-04-20
* gnu: Add NCBI VDB.Ricardo Wurmus2015-04-20
* gnu: Add NGS Java bindings.Ricardo Wurmus2015-04-20
* gnu: Add NGS SDK.Ricardo Wurmus2015-04-20
* gnu: Add Biopython.Ricardo Wurmus2015-04-20