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* gnu: Add WarpedLMM.Ricardo Wurmus2015-07-02
* gnu: Add Blast+.Ricardo Wurmus2015-06-29
* gnu: Add plink.Ricardo Wurmus2015-06-29
* gnu: Add hmmer.Ben Woodcroft2015-06-24
* gnu: star: Update to 2.4.2a.Ricardo Wurmus2015-06-23
* gnu: miso: Install executables.Ricardo Wurmus2015-06-23
* gnu: Add idr.Ricardo Wurmus2015-06-23
* gnu: Add fasttree.Ben Woodcroft2015-06-21
* gnu: Add diamond.Ben Woodcroft2015-06-17
* gnu: miso: Use HTTPS URL.Ricardo Wurmus2015-06-17
* gnu: bedops: Update to 2.4.14.Ricardo Wurmus2015-06-17
* gnu: orfm: Update to 0.4.1.Ricardo Wurmus2015-06-15
* gnu: Add OrfM.Ben Woodcroft2015-06-12
* gnu: Add Couger.Ricardo Wurmus2015-06-12
* gnu: ngs-sdk: Update to version 1.1.1.Ricardo Wurmus2015-06-12
* gnu: Add HTSlib.Ricardo Wurmus2015-06-02
* gnu: ncbi-vdb: Use "i386" instead of "i686" in directory name.Ricardo Wurmus2015-06-02
* gnu: Add edirect.Ricardo Wurmus2015-05-27
* gnu: shogun: Remove non-free source files.Ricardo Wurmus2015-05-27
* gnu: Add rsem.Ricardo Wurmus2015-05-22
* gnu: vcftools: Remove "-m64" from CFLAGS.Ricardo Wurmus2015-05-05
* gnu: bamtools: Set rpath via LDFLAGS.Ricardo Wurmus2015-05-04
* gnu: Add samtools-0.1.19.Ricardo Wurmus2015-05-04
* gnu: samtools: Install libbam.a library.Ricardo Wurmus2015-05-04
* gnu: samtools: Remove patch-makefile-curses phase.Ricardo Wurmus2015-05-04
* gnu: flexbar: Enable tests.Ricardo Wurmus2015-04-27
* gnu: Add eXpress.Ricardo Wurmus2015-04-21
* gnu: Add bamtools.Ricardo Wurmus2015-04-21
* gnu: Add subread.Ricardo Wurmus2015-04-21
* gnu: Add sra-tools.Ricardo Wurmus2015-04-20
* gnu: Add NCBI VDB.Ricardo Wurmus2015-04-20
* gnu: Add NGS Java bindings.Ricardo Wurmus2015-04-20
* gnu: Add NGS SDK.Ricardo Wurmus2015-04-20
* gnu: Add Biopython.Ricardo Wurmus2015-04-20
* gnu: Add FASTX Toolkit.Ricardo Wurmus2015-04-16
* gnu: rseqc: Update hash.Ricardo Wurmus2015-04-13
* gnu: Add GRIT.Ricardo Wurmus2015-04-10
* gnu: Add Shogun.Ricardo Wurmus2015-04-09
* gnu: Add clustal omega.Ricardo Wurmus2015-04-01
* gnu: pbtranscript-tofu: Add missing inputs.Ricardo Wurmus2015-03-31
* gnu: pbtranscript-tofu: Delete pre-built libraries.Ricardo Wurmus2015-03-31
* gnu: Add vcftools.Ricardo Wurmus2015-03-31
* gnu: Add cutadapt.Ricardo Wurmus2015-03-31
* gnu: Add pbtranscript-tofu.Ricardo Wurmus2015-03-24
* gnu: Add python2-bx-python.Ricardo Wurmus2015-03-24
* gnu: Add python2-pbcore.Ricardo Wurmus2015-03-24
* gnu: Add MISO.Ricardo Wurmus2015-03-17
* gnu: Add bwa.Ricardo Wurmus2015-03-17
* gnu: Add htsjdk.Ricardo Wurmus2015-03-10
* Merge branch 'core-updates'.Ludovic Courtès2015-03-04
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