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* gnu: Update diamond to 0.8.3.Ben Woodcroft2016-05-28
* gnu: Add ParDRe.Ricardo Wurmus2016-05-23
* gnu: r-genomation: Update to 1.4.2.Ricardo Wurmus2016-05-20
* gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.24.2.Ricardo Wurmus2016-05-20
* gnu: r-summarizedexperiment: Update to 1.2.2.Ricardo Wurmus2016-05-20
* gnu: r-biocparallel: Update to 1.6.2.Ricardo Wurmus2016-05-20
* gnu: r-annotationdbi: Update to 1.34.2.Ricardo Wurmus2016-05-20
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* gnu: r-genomeinfodb: Update to 1.8.1.Ricardo Wurmus2016-05-20
* gnu: diamond: Do not specify target architecture.Ben Woodcroft2016-05-18
* gnu: Add Piranha.Ricardo Wurmus2016-05-18
* gnu: sortmerna: Update to 2.1b.Ben Woodcroft2016-05-17
* gnu: vsearch: Update to 1.11.1.Ben Woodcroft2016-05-17
* gnu: diamond: Update to 0.8.1.Ben Woodcroft2016-05-17
* gnu: r-zlibbioc: Update to 1.18.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-motifrg: Update to 1.16.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-seqlogo: Update to 1.38.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-genomation: Update to 1.4.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-seqpattern: Update to 1.4.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-impute: Update to 1.46.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-bsgenome: Update to 1.40.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-topgo: Update to 2.24.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-graph: Update to 1.50.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.24.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-rtracklayer: Update to 1.32.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-genomicalignments: Update to 1.8.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-summarizedexperiment: Update to 1.2.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-rsamtools: Update to 1.24.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-biostrings: Update to 2.40.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-biocparallel: Update to 1.6.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-biomart: Update to 2.28.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-annotationdbi: Update to 1.34.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-biobase: Update to 2.32.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-genomicranges: Update to 1.24.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-xvector: Update to 0.12.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-variantannotation: Update to 1.18.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-genomeinfodb: Update to 1.8.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-iranges: Update to 2.6.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-s4vectors: Update to 0.10.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-dnacopy: Update to 1.46.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: r-biocgenerics: Update to 0.18.0.Ricardo Wurmus2016-05-16
* gnu: hmmer: Update urls.Efraim Flashner2016-05-16
* gnu: Update module imports for asciidoc and doxygen.Mark H Weaver2016-05-12
* gnu: edirect: Update to 4.10.Ricardo Wurmus2016-05-04
* gnu: Add muscle.Ben Woodcroft2016-04-30
* gnu: r-acsnminer: Update to 0.16.01.29.Ricardo Wurmus2016-04-26
* gnu: r-qtl: Update to 1.39-5.Ricardo Wurmus2016-04-26
* gnu: Add filevercmp.Roel Janssen2016-04-26
* gnu: samtools: Update to 1.3.1.Ben Woodcroft2016-04-24
* gnu: Rename Java packages to match new naming specification.Hartmut Goebel2016-04-19