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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
Commit message (Expand)AuthorAge
* gnu: python2-dendropy: Disable failing test.Ben Woodcroft2018-10-21
* gnu: bowtie: Update to 2.3.4.3.Ricardo Wurmus2018-10-20
* gnu: blast+: Use INVOKE and return #T unconditionally.Ricardo Wurmus2018-10-20
* gnu: bedops: Update to 2.4.35.Ricardo Wurmus2018-10-20
* gnu: bedops: Use INVOKE.Ricardo Wurmus2018-10-20
* gnu: bamm: Fetch from git and use INVOKE.Ricardo Wurmus2018-10-20
* gnu: aragorn: Use invoke and simplify.Ricardo Wurmus2018-10-20
* gnu: clipper: Update to 1.2.1.Ricardo Wurmus2018-10-20
* gnu: python-pybedtools: Update to 0.7.10.Ricardo Wurmus2018-10-20
* gnu: Add bedtools-2.26.Ricardo Wurmus2018-10-20
* gnu: kallisto: Update to 0.44.0.Ricardo Wurmus2018-10-11
* gnu: Add filtlong.pimi2018-10-08
* gnu: Add ngless.Ricardo Wurmus2018-10-05
* gnu: bioruby: Update to 1.5.2.Christopher Baines2018-10-05
* gnu: samtools-0.1: Adjust to match changes in samtools.Ricardo Wurmus2018-10-05
* gnu: deeptools: Update to 3.1.2.Ricardo Wurmus2018-10-05
* gnu: python-pysam: Update to 0.15.1.Ricardo Wurmus2018-10-05
* gnu: bcftools: Update to 1.9.Ricardo Wurmus2018-10-05
* gnu: samtools: Update to 1.9.Ricardo Wurmus2018-10-05
* gnu: htslib: Update to 1.9.Ricardo Wurmus2018-10-05
* gnu: Add r-absfiltergsea.pimi2018-10-02
* gnu: Add poretools.pimi2018-10-02
* gnu: Add porechop.pimi2018-09-30
* gnu: Add r-bseqsc.Ricardo Wurmus2018-09-24
* gnu: Add r-cssam.Ricardo Wurmus2018-09-24
* gnu: Add r-xbioc.Ricardo Wurmus2018-09-24
* gnu: hmmer: Update to 3.2.1.Ben Woodcroft2018-09-22
* gnu: Add r-pore.pimi2018-09-21
* gnu: rsem: Update to 1.3.1.Ricardo Wurmus2018-09-20
* gnu: Add python-hic2cool.Ricardo Wurmus2018-09-14
* Adjust all users of (gnu packages ldc) to use (gnu packages dlang).Leo Famulari2018-09-10
* gnu: Add python-pygenometracks.Ricardo Wurmus2018-09-10
* gnu: Add python-hicexplorer.Ricardo Wurmus2018-09-10
* gnu: Add python-cooler.Ricardo Wurmus2018-09-10
* gnu: Add python-pyfaidx.Ricardo Wurmus2018-09-10
* gnu: Add python-pypairix.Ricardo Wurmus2018-09-10
* gnu: Add python-intervaltree.Ricardo Wurmus2018-09-10
* gnu: r-annotationhub: Update to 2.12.1.Ricardo Wurmus2018-09-09
* Add missing use-modules clause.Ricardo Wurmus2018-09-06
* gnu: pigx-scrnaseq: Use latest version of Pandoc.Ricardo Wurmus2018-09-05
* gnu: pigx-bsseq: Use latest version of Pandoc.Ricardo Wurmus2018-09-05
* gnu: pigx-chipseq: Use latest version of Pandoc.Ricardo Wurmus2018-09-05
* gnu: pigx-rnaseq: Use latest version of Pandoc.Ricardo Wurmus2018-09-05
* gnu: r-rcas: Use standard version of ghc-pandoc-citeproc.Ricardo Wurmus2018-09-05
* gnu: r-graph: Move from bioinformatics to bioconductor.Ricardo Wurmus2018-09-05
* gnu: r-scran: Update to 1.8.4.Ricardo Wurmus2018-09-05
* gnu: r-scater: Update to 1.8.4.Ricardo Wurmus2018-09-05
* gnu: r-hdf5array: Update to 1.8.1.Ricardo Wurmus2018-09-05
* gnu: r-ggbio: Update to 1.28.5.Ricardo Wurmus2018-09-05
* gnu: r-biovizbase: Update to 1.28.2.Ricardo Wurmus2018-09-05