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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
Commit message (Expand)AuthorAge
* gnu: multiqc: Update to 1.4.Marius Bakke2018-02-07
* Merge branch 'master' into core-updatesMark H Weaver2018-02-03
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| * gnu: diamond: Update to 0.9.17.Ben Woodcroft2018-02-02
* | Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke2018-02-01
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| * gnu: diamond: Update to 0.9.16.Ben Woodcroft2018-01-27
* | Merge branch 'master' into core-updatesMark H Weaver2018-01-26
|\|
| * gnu: diamond: Update to 0.9.15.Ben Woodcroft2018-01-26
| * gnu: deeptools: Update URI.Tobias Geerinckx-Rice2018-01-26
* | Merge branch 'master' into core-updatesMark H Weaver2018-01-23
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| * gnu: star: Make reproducible.Ricardo Wurmus2018-01-22
| * gnu: khmer: Add aarch64-linux to supported systems.Efraim Flashner2018-01-22
| * gnu: Add salmon.Ricardo Wurmus2018-01-21
| * gnu: Add sailfish.Ricardo Wurmus2018-01-21
| * gnu: Add libdivsufsort.Ricardo Wurmus2018-01-21
| * gnu: Add libgff.Ricardo Wurmus2018-01-21
* | Merge branch 'master' into core-updatesLeo Famulari2018-01-11
|\|
| * gnu: seqmagick: Use 'pypi-uri'.Ben Woodcroft2018-01-10
| * gnu: mafft: Update to 7.313.Ben Woodcroft2018-01-10
| * gnu: seqmagick: Update to 0.7.0.Ben Woodcroft2018-01-09
* | Merge branch 'master' into core-updatesLeo Famulari2018-01-03
|\|
| * gnu: htslib: Mark up description.Tobias Geerinckx-Rice2018-01-02
| * gnu: ribotaper: Wrap executables.Ricardo Wurmus2018-01-02
| * gnu: python-pysam: Update to 0.13.0.Tobias Geerinckx-Rice2018-01-02
| * gnu: htslib: Update to 1.6.Tobias Geerinckx-Rice2018-01-02
* | Merge remote-tracking branch 'origin/master' into core-updatesEfraim Flashner2017-12-31
|\|
| * gnu: vsearch: Update to 2.6.2.Ben Woodcroft2017-12-27
| * gnu, doc: Use HTTPS for cran.r-project.org home pages.Tobias Geerinckx-Rice2017-12-24
| * gnu: Update r-mutationalpatterns to 1.4.2.Roel Janssen2017-12-22
* | Merge branch 'master' into core-updatesLeo Famulari2017-12-21
|\|
| * gnu: r-biomart: Update to 2.34.1.Ricardo Wurmus2017-12-19
| * gnu: r-gviz: Update to 1.22.2.Ricardo Wurmus2017-12-19
| * gnu: r-gqtlstats: Update to 1.10.1.Ricardo Wurmus2017-12-19
| * gnu: r-rtracklayer: Update to 1.38.2.Ricardo Wurmus2017-12-19
| * gnu: r-limma: Update to 3.34.4.Ricardo Wurmus2017-12-19
| * gnu: r-edger: Update to 3.20.2.Ricardo Wurmus2017-12-19
| * gnu: r-biocstyle: Update to 2.6.1.Ricardo Wurmus2017-12-19
| * gnu: r-dexseq: Update to 1.24.2.Ricardo Wurmus2017-12-19
| * gnu: r-vegan: Update to 2.4-5.Ricardo Wurmus2017-12-19
* | gnu: Remove redundant cmake libdir configure flags.Efraim Flashner2017-12-19
|/
* gnu: r-seurat: Update to 2.1.0.Ricardo Wurmus2017-12-18
* gnu: r-seurat: Fix ModularityOptimizer.jar.Ricardo Wurmus2017-12-18
* gnu: bedtools: Update to 2.27.1.Ben Woodcroft2017-12-15
* gnu: diamond: Update to 0.9.14.Ben Woodcroft2017-12-14
* gnu: Switch to using the version-major procedure.Christopher Baines2017-12-11
* gnu: bedtools-2.18: Fix build.Ricardo Wurmus2017-12-09
* gnu: bedtools: Update to 2.27.0.Ricardo Wurmus2017-12-06
* gnu: Add kallisto.Ricardo Wurmus2017-12-03
* gnu: jellyfish: Update to 2.2.7.Ricardo Wurmus2017-11-30
* gnu: r-annotationhub: Update to 2.10.1.Ricardo Wurmus2017-11-30
* gnu: r-msnid: Update to 1.12.1.Ricardo Wurmus2017-11-30