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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
Commit message (Expand)AuthorAge
* gnu: Add r-catch.Ricardo Wurmus2021-09-01
* gnu: Add scregseg.Ricardo Wurmus2021-08-31
* gnu: python-strawc: Propagate pybind11.Ricardo Wurmus2021-08-31
* gnu: python-scanpy: Propagate sinfo.Ricardo Wurmus2021-08-31
* gnu: Add python-coolbox.Ricardo Wurmus2021-08-30
* gnu: python-scanpy: Update to 1.8.1.Ricardo Wurmus2021-08-30
* gnu: Add python-dna-features-viewer.Ricardo Wurmus2021-08-30
* gnu: Add python-pybbi.Ricardo Wurmus2021-08-30
* gnu: Add python-strawc.Ricardo Wurmus2021-08-27
* gnu: Add r-cytonorm.Ricardo Wurmus2021-08-27
* gnu: Add ivar.Ricardo Wurmus2021-08-25
* gnu: fastp: Update to 0.20.1.Ricardo Wurmus2021-08-20
* gnu: pigx-rnaseq: Update to 0.0.19.Ricardo Wurmus2021-08-13
* gnu: pigx-rnaseq: Update to 0.0.18.Ricardo Wurmus2021-08-11
* gnu: pigx-sars-cov2-ww: Update to 0.0.3.Ricardo Wurmus2021-08-05
* gnu: Add r-spectre.Ricardo Wurmus2021-08-03
* gnu: Add seqan 3.Ricardo Wurmus2021-07-26
* gnu: Add segemehl.Ricardo Wurmus2021-07-26
* gnu: python-pysam: Make the check phase honor the tests? argument.Efraim Flashner2021-07-22
* gnu: python-pysam: Update to 0.16.0.1.Efraim Flashner2021-07-22
* gnu: Add htslib-1.10.Efraim Flashner2021-07-22
* gnu: python-biopython: Update to 1.73.Efraim Flashner2021-07-22
* gnu: Add r-battenberg.Lars-Dominik Braun2021-07-21
* gnu: Add r-ascat.Lars-Dominik Braun2021-07-21
* gnu: Add nanosv.Lars-Dominik Braun2021-07-21
* gnu: Add python-pyvcf.Lars-Dominik Braun2021-07-21
* gnu: checkm: Rename and update to 1.1.3.Lars-Dominik Braun2021-07-21
* gnu: Add tombo.Lars-Dominik Braun2021-07-21
* gnu: Add ocaml-sqlite3.Julien Lepiller2021-07-05
* gnu: bioperl-minimal: Avoid top-level cross-module references.Ludovic Courtès2021-07-01
* gnu: Do not import (gnu packages commencement).Ludovic Courtès2021-07-01
* gnu: ensembl-vep: Use a source file-name.Efraim Flashner2021-06-22
* gnu: Add perl-cworld-dekker.Ricardo Wurmus2021-06-22
* gnu: Add python-iced.Ricardo Wurmus2021-06-21
* gnu: Add python-cgatcore.Ricardo Wurmus2021-06-14
* gnu: Rename qtbase to qtbase-5.Maxim Cournoyer2021-06-14
* gnu: pigx-sars-cov2-ww: Update to 0.0.2.Ricardo Wurmus2021-06-08
* gnu: pigx-bsseq: Update to 0.1.5.Ricardo Wurmus2021-06-08
* gnu: python-hicmatrix: Update to 15.Mădălin Ionel Patrașcu2021-06-08
* gnu: python-mappy: Move to (gnu packages bioinformatics).Efraim Flashner2021-06-08
* gnu: pigx-rnaseq: Update to 0.0.17.Ricardo Wurmus2021-06-08
* gnu: pigx-rnaseq: Adjust to upgrade of salmon.Ricardo Wurmus2021-06-07
* gnu: salmon: Update to 1.4.0.Ricardo Wurmus2021-06-07
* gnu: macs: Update to 2.2.7.1.Ricardo Wurmus2021-06-07
* gnu: libgff: Update to 2.0.0.Ricardo Wurmus2021-06-07
* gnu: jellyfish: Update to 2.3.0.Ricardo Wurmus2021-06-07
* gnu: multiqc: Update to 1.10.1.Ricardo Wurmus2021-06-07
* gnu: python-hic2cool: Update to 0.8.3.Mădălin Ionel Patrașcu2021-06-07
* gnu: freebayes: Update to 1.3.5.Efraim Flashner2021-06-06
* gnu: python-cooler: Update to 0.8.11.Mădălin Ionel Patrașcu2021-06-06