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\| *	gnu: ritornello: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: snap-aligner: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: sortmerna: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: vsearch: Fetch source from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: preseq: Update to 2.0.3.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: preseq: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: seqtk: Update to 1.3.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: seqtk: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: raxml: Update to 8.2.12.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: python2-biom-format: Fix build.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: raxml: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: pyicoteo: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: hplip: Remove bundled non-free blobs.	Efraim Flashner	2018-11-07
\| *	pull: Add missing monadic 'return'.	Ludovic Courtès	2018-11-07
\| *	gnu: sra-tools: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: libgff: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: kentutils: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: r-seqgl: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: pplacer: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: minced: Update to 0.3.2.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: minced: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: metabat: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: mash: Update to 2.1.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: mash: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
* \|	Merge branch 'master' into core-updates	Marius Bakke	2018-11-07
\|\\|
\| *	gnu: fio: Update to 3.11.	Marius Bakke	2018-11-07
\| *	gnu: kaiju: Update to 1.6.3.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: kaiju: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: idr: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: java-htsjdk: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: hisat2: Use versioned source URL.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: grit: Update to 2.0.5.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: grit: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: gemma: Update to 0.98.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: gemma: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: clementine: Build with sqlite-with-column-metadata.	Pierre Langlois	2018-11-07
\| *	gnu: fxtract: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: ribodiff: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: python-biom-format: Update to 2.1.7.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: python-biom-format: Fetch source from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: bioawk: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: bedtools-2.18: Fetch sources from stable URL.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: bamtools: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: ngless: Install links to required tools.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: prodigal: Fetch sources from git.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	services: cuirass: Add 'ttl' configuration field.	Ludovic Courtès	2018-11-07
\| *	gnu: cuirass: Update to 0b40dca.	Ludovic Courtès	2018-11-07
\| *	linux-initrd: Make sure 'build-initrd' can delete files.	Ludovic Courtès	2018-11-07
\| *	gnu: r-mzr: Update to 2.16.0.	Ricardo Wurmus	2018-11-07
\| *	gnu: r-rhdf5lib: Update to 1.4.0.	Ricardo Wurmus	2018-11-07