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* Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke2019-08-13
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| * gnu: freebayes: Simplify and enable tests.Ricardo Wurmus2019-08-09
| * gnu: freebayes: Move bamtools to inputs.Ricardo Wurmus2019-08-09
| * gnu: Add freebayes.Pierre Neidhardt2019-08-09
| * gnu: Add vcflib.Pierre Neidhardt2019-08-09
| * gnu: r-hdf5array: Update to 1.12.2.Ricardo Wurmus2019-08-08
| * gnu: r-biocparallel: Update to 1.18.1.Ricardo Wurmus2019-08-08
| * Revert "gnu: Add vcflib."Efraim Flashner2019-08-08
| * Revert "gnu: Add freebayes."Efraim Flashner2019-08-08
| * gnu: Add freebayes.Pierre Neidhardt2019-08-08
| * gnu: Add vcflib.Pierre Neidhardt2019-08-08
| * gnu: Add fastahack.Pierre Neidhardt2019-08-08
| * gnu: Add fsom.Pierre Neidhardt2019-08-08
| * gnu: Add multichoose.Pierre Neidhardt2019-08-08
| * gnu: Add smithwaterman.Pierre Neidhardt2019-08-08
| * gnu: Add tabixpp.Pierre Neidhardt2019-08-08
| * gnu: Remove ghc-parsec, ghc-stm, ghc-text, ghc-xhtml.Robert Vollmert2019-08-07
| * gnu: r-msnid: Update to 1.18.1.Ricardo Wurmus2019-08-06
| * gnu: r-rcas: Update to 1.10.1.Ricardo Wurmus2019-08-06
| * gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.36.4.Ricardo Wurmus2019-08-06
| * gnu: r-rtracklayer: Update to 1.44.2.Ricardo Wurmus2019-08-06
| * gnu: r-summarizedexperiment: Update to 1.14.1.Ricardo Wurmus2019-08-06
| * gnu: r-biomart: Update to 2.40.3.Ricardo Wurmus2019-08-06
| * gnu: r-limma: Update to 3.40.6.Ricardo Wurmus2019-08-06
| * gnu: r-edger: Update to 3.26.6.Ricardo Wurmus2019-08-06
| * gnu: khmer: Make gzip timestamps writable.Brian Leung2019-08-05
* | gnu: prank: Update to 170427.Marius Bakke2019-07-31
* | Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke2019-07-31
|\|
| * gnu: Explicitly refer to 'guile-json-1' when needed.Ludovic Courtès2019-07-25
* | Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke2019-07-22
|\|
| * gnu: htslib: Propagate zlib.Ricardo Wurmus2019-07-22
* | gnu: bpp: Use the default GCC.Marius Bakke2019-07-18
* | Merge branch 'master' into core-updatesLudovic Courtès2019-07-17
|\|
| * gnu: Add python-ont-fast5-api.Ricardo Wurmus2019-07-15
| * gnu: pigx-rnaseq: Update to 0.0.10.Ricardo Wurmus2019-07-13
* | gnu: nanopolish: Fix build with GCC 7.Marius Bakke2019-07-17
* | gnu: salmon: Fix build with GCC 7.Marius Bakke2019-07-15
* | gnu: Adjust uses of C{,PLUS}_INCLUDE_PATH for GCC 7.Marius Bakke2019-07-14
* | Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke2019-07-12
|\|
| * gnu: r-biocinstaller: Remove entirely.Tobias Geerinckx-Rice2019-07-09
| * gnu: Remove r-biocinstaller.Tobias Geerinckx-Rice2019-07-08
| * gnu: r-xbioc: Update to 0.1.16-1.6ff0670.Tobias Geerinckx-Rice2019-07-08
| * gnu: nanopolish: Update to 0.11.1-1.6331dc4.Ricardo Wurmus2019-07-05
* | gnu: Remove ghc-parsec, ghc-stm, ghc-text, ghc-xhtml.Robert Vollmert2019-07-04
|/
* gnu: pigx-rnaseq: Update to 0.0.8.Ricardo Wurmus2019-07-04
* gnu: r-phangorn: Update to 2.5.5.Ricardo Wurmus2019-06-29
* gnu: r-tximport: Update to 1.12.3.Ricardo Wurmus2019-06-29
* gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.36.3.Ricardo Wurmus2019-06-29
* gnu: r-genomicalignments: Update to 1.20.1.Ricardo Wurmus2019-06-29
* gnu: r-biomart: Update to 2.40.1.Ricardo Wurmus2019-06-29
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