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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
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* gnu: Add samblaster.Ricardo Wurmus2019-09-06
* gnu: libbigwig: Update to 0.4.4.Ricardo Wurmus2019-09-05
* gnu: python-pyfaidx: Remove python-setuptools as an input.Christopher Baines2019-09-05
* gnu: umi-tools: Remove python-setuptools as an input.Christopher Baines2019-09-05
* gnu: bwa-meth: Capture one more reference to "bwa".Ricardo Wurmus2019-09-05
* gnu: r-ldblock: Update to 1.14.2.Ricardo Wurmus2019-09-02
* gnu: r-seurat: Update to 3.1.0.Ricardo Wurmus2019-09-02
* gnu: r-rtracklayer: Update to 1.44.3.Ricardo Wurmus2019-09-02
* gnu: r-biomart: Update to 2.40.4.Ricardo Wurmus2019-09-02
* gnu: r-annotationdbi: Update to 1.46.1.Ricardo Wurmus2019-09-02
* gnu: r-iranges: Update to 2.18.2.Ricardo Wurmus2019-09-02
* gnu: Move non-compilers out of haskell.scm.Robert Vollmert2019-08-31
* gnu: edirect: Update to 12.1.20190819.Efraim Flashner2019-08-20
* gnu: r-gviz: Update to 1.28.1.Ricardo Wurmus2019-08-19
* gnu: r-edger: Update to 3.26.7.Ricardo Wurmus2019-08-16
* gnu: freebayes: Simplify and enable tests.Ricardo Wurmus2019-08-09
* gnu: freebayes: Move bamtools to inputs.Ricardo Wurmus2019-08-09
* gnu: Add freebayes.Pierre Neidhardt2019-08-09
* gnu: Add vcflib.Pierre Neidhardt2019-08-09
* gnu: r-hdf5array: Update to 1.12.2.Ricardo Wurmus2019-08-08
* gnu: r-biocparallel: Update to 1.18.1.Ricardo Wurmus2019-08-08
* Revert "gnu: Add vcflib."Efraim Flashner2019-08-08
* Revert "gnu: Add freebayes."Efraim Flashner2019-08-08
* gnu: Add freebayes.Pierre Neidhardt2019-08-08
* gnu: Add vcflib.Pierre Neidhardt2019-08-08
* gnu: Add fastahack.Pierre Neidhardt2019-08-08
* gnu: Add fsom.Pierre Neidhardt2019-08-08
* gnu: Add multichoose.Pierre Neidhardt2019-08-08
* gnu: Add smithwaterman.Pierre Neidhardt2019-08-08
* gnu: Add tabixpp.Pierre Neidhardt2019-08-08
* gnu: Remove ghc-parsec, ghc-stm, ghc-text, ghc-xhtml.Robert Vollmert2019-08-07
* gnu: r-msnid: Update to 1.18.1.Ricardo Wurmus2019-08-06
* gnu: r-rcas: Update to 1.10.1.Ricardo Wurmus2019-08-06
* gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.36.4.Ricardo Wurmus2019-08-06
* gnu: r-rtracklayer: Update to 1.44.2.Ricardo Wurmus2019-08-06
* gnu: r-summarizedexperiment: Update to 1.14.1.Ricardo Wurmus2019-08-06
* gnu: r-biomart: Update to 2.40.3.Ricardo Wurmus2019-08-06
* gnu: r-limma: Update to 3.40.6.Ricardo Wurmus2019-08-06
* gnu: r-edger: Update to 3.26.6.Ricardo Wurmus2019-08-06
* gnu: khmer: Make gzip timestamps writable.Brian Leung2019-08-05
* gnu: Explicitly refer to 'guile-json-1' when needed.Ludovic Courtès2019-07-25
* gnu: htslib: Propagate zlib.Ricardo Wurmus2019-07-22
* gnu: Add python-ont-fast5-api.Ricardo Wurmus2019-07-15
* gnu: pigx-rnaseq: Update to 0.0.10.Ricardo Wurmus2019-07-13
* gnu: r-biocinstaller: Remove entirely.Tobias Geerinckx-Rice2019-07-09
* gnu: Remove r-biocinstaller.Tobias Geerinckx-Rice2019-07-08
* gnu: r-xbioc: Update to 0.1.16-1.6ff0670.Tobias Geerinckx-Rice2019-07-08
* gnu: nanopolish: Update to 0.11.1-1.6331dc4.Ricardo Wurmus2019-07-05
* gnu: pigx-rnaseq: Update to 0.0.8.Ricardo Wurmus2019-07-04
* gnu: r-phangorn: Update to 2.5.5.Ricardo Wurmus2019-06-29