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* gnu: Add salmon.Ricardo Wurmus2018-01-21
* gnu: Add sailfish.Ricardo Wurmus2018-01-21
* gnu: Add libdivsufsort.Ricardo Wurmus2018-01-21
* gnu: Add libgff.Ricardo Wurmus2018-01-21
* gnu: seqmagick: Use 'pypi-uri'.Ben Woodcroft2018-01-10
* gnu: mafft: Update to 7.313.Ben Woodcroft2018-01-10
* gnu: seqmagick: Update to 0.7.0.Ben Woodcroft2018-01-09
* gnu: htslib: Mark up description.Tobias Geerinckx-Rice2018-01-02
* gnu: ribotaper: Wrap executables.Ricardo Wurmus2018-01-02
* gnu: python-pysam: Update to 0.13.0.Tobias Geerinckx-Rice2018-01-02
* gnu: htslib: Update to 1.6.Tobias Geerinckx-Rice2018-01-02
* gnu: vsearch: Update to 2.6.2.Ben Woodcroft2017-12-27
* gnu, doc: Use HTTPS for cran.r-project.org home pages.Tobias Geerinckx-Rice2017-12-24
* gnu: Update r-mutationalpatterns to 1.4.2.Roel Janssen2017-12-22
* gnu: r-biomart: Update to 2.34.1.Ricardo Wurmus2017-12-19
* gnu: r-gviz: Update to 1.22.2.Ricardo Wurmus2017-12-19
* gnu: r-gqtlstats: Update to 1.10.1.Ricardo Wurmus2017-12-19
* gnu: r-rtracklayer: Update to 1.38.2.Ricardo Wurmus2017-12-19
* gnu: r-limma: Update to 3.34.4.Ricardo Wurmus2017-12-19
* gnu: r-edger: Update to 3.20.2.Ricardo Wurmus2017-12-19
* gnu: r-biocstyle: Update to 2.6.1.Ricardo Wurmus2017-12-19
* gnu: r-dexseq: Update to 1.24.2.Ricardo Wurmus2017-12-19
* gnu: r-vegan: Update to 2.4-5.Ricardo Wurmus2017-12-19
* gnu: r-seurat: Update to 2.1.0.Ricardo Wurmus2017-12-18
* gnu: r-seurat: Fix ModularityOptimizer.jar.Ricardo Wurmus2017-12-18
* gnu: bedtools: Update to 2.27.1.Ben Woodcroft2017-12-15
* gnu: diamond: Update to 0.9.14.Ben Woodcroft2017-12-14
* gnu: Switch to using the version-major procedure.Christopher Baines2017-12-11
* gnu: bedtools-2.18: Fix build.Ricardo Wurmus2017-12-09
* gnu: bedtools: Update to 2.27.0.Ricardo Wurmus2017-12-06
* gnu: Add kallisto.Ricardo Wurmus2017-12-03
* gnu: jellyfish: Update to 2.2.7.Ricardo Wurmus2017-11-30
* gnu: r-annotationhub: Update to 2.10.1.Ricardo Wurmus2017-11-30
* gnu: r-msnid: Update to 1.12.1.Ricardo Wurmus2017-11-30
* gnu: r-maldiquant: Update to 1.17.Ricardo Wurmus2017-11-30
* gnu: r-genomicalignments: Update to 1.14.1.Ricardo Wurmus2017-11-30
* gnu: r-limma: Update to 3.34.2.Ricardo Wurmus2017-11-30
* gnu: r-variantannotation: Update to 1.24.2.Ricardo Wurmus2017-11-30
* gnu: r-getopt: Update to 1.20.1.Ricardo Wurmus2017-11-30
* gnu: r-gseabase: Update to 1.40.1.Ricardo Wurmus2017-11-30
* gnu: r-dexseq: Update to 1.24.1.Ricardo Wurmus2017-11-30
* gnu: r-deseq2: Update to 1.18.1.Ricardo Wurmus2017-11-30
* gnu: r-annotate: Update to 1.56.1.Ricardo Wurmus2017-11-30
* gnu: metabat: Use scons-build-system.Arun Isaac2017-11-30
* gnu: Update r-mutationalpatterns to 1.4.1.Roel Janssen2017-11-29
* gnu: Add r-copynumber.Roel Janssen2017-11-29
* gnu: Add java-picard-1.113.Ricardo Wurmus2017-11-27
* gnu: Add java-picard.Ricardo Wurmus2017-11-27
* gnu: java-htsjdk: Update to 2.3.0.Ricardo Wurmus2017-11-27
* gnu: r-rhdf5: Fix build phase.Ricardo Wurmus2017-11-27
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