index
:
gds/gnu-guix
guix-for-govuk-mini-environment-admin
release
release_2
spike-end-to-end-test-system
spike-local-development-system-container
wip-postgresql-ssl
This repository contains snapshots of GNU Guix, to be used by the govuk-guix project.
Gitolite user
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refs
log
tree
commit
diff
log msg
author
committer
range
path:
root
/
gnu
/
packages
/
bioinformatics.scm
Commit message (
Expand
)
Author
Age
*
Merge branch 'master' into core-updates
Marius Bakke
2020-04-11
|
\
|
*
gnu: minimap2: Fix cond expression for Guile 3 compatibility.
Marius Bakke
2020-04-09
*
|
Merge branch 'master' into core-updates
Marius Bakke
2020-04-08
|
\
|
|
*
gnu: python-intervaltree: Update to 3.0.2.
Jakub Kądziołka
2020-04-05
|
*
gnu: r-biomart: Update to 2.42.1.
Ricardo Wurmus
2020-04-01
|
*
gnu: r-genomeinfodb: Update to 1.22.1.
Ricardo Wurmus
2020-04-01
*
|
gnu: sailfish: Fix build failure.
Marius Bakke
2020-04-03
*
|
Merge branch 'master' into core-updates
Marius Bakke
2020-03-27
|
\
|
|
*
gnu: Update sambamba to 0.7.1.
Roel Janssen
2020-03-26
|
*
gnu: r-tximport: Update to 1.14.2.
Ricardo Wurmus
2020-03-24
|
*
gnu: edirect: Install more programs.
Efraim Flashner
2020-03-22
|
*
gnu: Add edirect-go-programs.
Efraim Flashner
2020-03-22
*
|
Merge branch 'master' into core-updates
Marius Bakke
2020-03-18
|
\
|
|
*
gnu: pigx-scrnaseq: Update to 1.1.4.
Ricardo Wurmus
2020-03-17
|
*
gnu: star: Update to 2.7.3a.
Ricardo Wurmus
2020-03-16
*
|
Merge branch 'master' into core-updates
Marius Bakke
2020-03-14
|
\
|
|
*
gnu: edirect: Update to 13.3.20200128.
Efraim Flashner
2020-03-12
|
*
gnu: r-qtl: Update to 1.46-2.
Ricardo Wurmus
2020-03-12
|
*
gnu: python-pybedtools: Update to 0.8.1.
Efraim Flashner
2020-03-11
|
*
gnu: python-pyfaidx: Update to 0.5.8.
Efraim Flashner
2020-03-11
|
*
gnu: Add python2-pyfaidx.
Efraim Flashner
2020-03-11
|
*
gnu: java-forester-1.005: Update source URI.
Björn Höfling
2020-03-10
*
|
gnu: salmon: Adjust for C_INCLUDE_PATH changes.
Marius Bakke
2020-03-13
|
/
*
gnu: Fix build of python-velocyto.
Roel Janssen
2020-03-09
*
gnu: ngless: Update to 1.1.0.
Ricardo Wurmus
2020-03-08
*
gnu: taxtastic: Update to 0.8.11.
Ricardo Wurmus
2020-03-08
*
gnu: r-methylkit: Add r-knitr.
Ricardo Wurmus
2020-03-07
*
gnu: r-vsn: Add r-knitr.
Ricardo Wurmus
2020-03-07
*
gnu: python-scanpy: Update to 1.4.5.1.
Ricardo Wurmus
2020-03-06
*
gnu: gess: Use WRAP-SCRIPT.
Ricardo Wurmus
2020-03-03
*
gnu: gess: Override PYTHONPATH.
Ricardo Wurmus
2020-03-03
*
gnu: r-seqminer: Update to 8.0.
Ricardo Wurmus
2020-03-02
*
gnu: r-hdf5array: Update to 1.14.3.
Ricardo Wurmus
2020-03-01
*
gnu: r-rsamtools: Update to 2.2.3.
Ricardo Wurmus
2020-03-01
*
gnu: r-edger: Update to 3.28.1.
Ricardo Wurmus
2020-03-01
*
gnu: r-seurat: Update to 3.1.4.
Ricardo Wurmus
2020-03-01
*
gnu: infernal: Update to 1.1.3.
Ricardo Wurmus
2020-02-27
*
gnu: vcftools: Update to 0.1.16.
Ricardo Wurmus
2020-02-27
*
gnu: bedtools: Update to 2.29.2.
Ricardo Wurmus
2020-02-27
*
gnu: rseqc: Update to 3.0.1.
Ricardo Wurmus
2020-02-27
*
gnu: proteinortho: Update to 6.0.14.
Ricardo Wurmus
2020-02-26
*
gnu: diamond: Update to 0.9.30.
Ricardo Wurmus
2020-02-26
*
gnu: crossmap: Update to 0.3.8.
Ricardo Wurmus
2020-02-26
*
gnu: macs: Update to 2.2.6.
Ricardo Wurmus
2020-02-26
*
gnu: Remove python-loompy-for-pigx-scrnaseq.
Ricardo Wurmus
2020-02-26
*
gnu: pigx-scrnaseq: Update to 1.1.3.
Ricardo Wurmus
2020-02-26
*
gnu: jamm: Update to 1.0.7.6.
Ricardo Wurmus
2020-02-25
*
gnu: r-scran: Update to 1.14.6.
Ricardo Wurmus
2020-02-19
*
gnu: r-hdf5array: Update to 1.14.2.
Ricardo Wurmus
2020-02-19
*
gnu: r-gviz: Update to 1.30.3.
Ricardo Wurmus
2020-02-19
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