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gds/gnu-guix
guix-for-govuk-mini-environment-admin
release
release_2
spike-end-to-end-test-system
spike-local-development-system-container
wip-postgresql-ssl
This repository contains snapshots of GNU Guix, to be used by the govuk-guix project.
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root
/
gnu
/
packages
/
bioinformatics.scm
Commit message (
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)
Author
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...
*
gnu: python-loompy: Update to 2.0.17.
Ricardo Wurmus
2019-03-13
*
gnu: Add tetoolkit.
Ricardo Wurmus
2019-03-13
*
gnu: r-qvalue: Move to (gnu packages bioconductor).
Ricardo Wurmus
2019-03-12
*
gnu: blast+: Update to 2.7.1.
Ricardo Wurmus
2019-03-08
*
gnu: r-mzr: Update to 2.16.2.
Ricardo Wurmus
2019-03-08
*
gnu: r-gviz: Update to 1.26.5.
Ricardo Wurmus
2019-03-08
*
gnu: r-ensembldb: Update to 2.6.7.
Ricardo Wurmus
2019-03-08
*
gnu: r-annotationhub: Update to 2.14.4.
Ricardo Wurmus
2019-03-08
*
gnu: r-rhtslib: Update to 1.14.1.
Ricardo Wurmus
2019-03-08
*
gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.34.4.
Ricardo Wurmus
2019-03-08
*
gnu: r-rtracklayer: Update to 1.42.2.
Ricardo Wurmus
2019-03-08
*
gnu: r-rsamtools: Update to 1.34.1.
Ricardo Wurmus
2019-03-08
*
gnu: r-biocparallel: Update to 1.16.6.
Ricardo Wurmus
2019-03-08
*
gnu: r-variantannotation: Update to 1.28.11.
Ricardo Wurmus
2019-03-08
*
gnu: r-genomeinfodb: Update to 1.18.2.
Ricardo Wurmus
2019-03-08
*
gnu: r-dexseq: Update to 1.28.2.
Ricardo Wurmus
2019-03-08
*
gnu: cd-hit: Support longer sequences.
Ricardo Wurmus
2019-03-07
*
gnu: r-org-mm-eg-db: Move to (gnu packages bioconductor).
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: r-org-hs-eg-db: Move to (gnu packages bioconductor).
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: r-org-dm-eg-db: Move to (gnu packages bioconductor).
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: r-org-ce-eg-db: Move to (gnu packages bioconductor).
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: r-txdb-mmusculus-ucsc-mm10-knowngene: Move to (gnu packages bioconductor).
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: r-bsgenome-dmelanogaster-ucsc-dm3: Move to (gnu packages bioconductor).
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: r-bsgenome-celegans-ucsc-ce10: Move to (gnu packages bioconductor).
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: r-bsgenome-celegans-ucsc-ce6: Move to (gnu packages bioconductor).
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: r-bsgenome-mmusculus-ucsc-mm10: Move to (gnu packages bioconductor).
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: r-bsgenome-mmusculus-ucsc-mm9: Move to (gnu packages bioconductor).
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: r-bsgenome-hsapiens-ucsc-hg19: Move to (gnu packages bioconductor).
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: r-bsgenome-hsapiens-1000genomes-hs37d5: Move to (gnu packages bioconduct...
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: r-txdb-hsapiens-ucsc-hg19-knowngene: Move to (gnu packages bioconductor).
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: r-geneplotter: Move to (gnu packages bioconductor).
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: r-copynumber: Move to (gnu packages bioconductor).
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: bismark: Update to 0.20.1.
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: Add r-scde.
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: Add bowtie1.
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: Add genrich.
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: r-dnacopy: Remove duplicate definition.
Ricardo Wurmus
2019-03-06
*
gnu: pigx-chipseq: Update to 0.0.31.
Ricardo Wurmus
2019-03-02
*
gnu: Add velvet.
Ricardo Wurmus
2019-03-01
*
gnu: discrover: Remove indirect TexLive dependencies.
Ricardo Wurmus
2019-03-01
*
gnu: flexbar: Fix reproducibility bug.
Ricardo Wurmus
2019-02-27
*
gnu: pigx-chipseq: Update to 0.0.21.
Ricardo Wurmus
2019-02-25
*
gnu: discrover: Replace "texlive" with a texlive-union.
Ricardo Wurmus
2019-02-25
*
gnu: pplacer: Remove the package, which is affected by a CVE on ocaml@4.01.
Andreas Enge
2019-02-19
*
gnu: Remove unneeded uses of python{,2}-minimal.
Marius Bakke
2019-02-17
*
gnu: Add python-pyfit-sne.
Ricardo Wurmus
2019-02-15
*
gnu: python-pybedtools: Update to 0.8.0 and fix build.
Maxim Cournoyer
2019-02-12
*
gnu: Add cnvkit.
Ricardo Wurmus
2019-02-12
*
gnu: rcas-web: Update to 0.1.0.
Ricardo Wurmus
2019-02-08
*
gnu: star: Update to 2.7.0b.
Ricardo Wurmus
2019-02-06
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