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gds/gnu-guix
guix-for-govuk-mini-environment-admin
release
release_2
spike-end-to-end-test-system
spike-local-development-system-container
wip-postgresql-ssl
This repository contains snapshots of GNU Guix, to be used by the govuk-guix project.
Gitolite user
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committer
range
path:
root
/
gnu
/
packages
/
bioinformatics.scm
Commit message (
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)
Author
Age
*
gnu: flexbar: Update to 3.4.0.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: seqan: Update to 2.4.0.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: khmer: Update to 2.1.2.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: python-screed: Update to 1.0.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: fasttree: Use INVOKE.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: express-beta-diversity: Update to 1.0.8.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: edirect: Update to 10.2.20181018.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: eigensoft: Update to 7.2.1.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: discrover: Fetch from git.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: diamond: Fetch from git.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: delly: Update to 0.7.9.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: deeptools: Update to 3.1.3.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: python-dendropy: Fetch from git.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: python-py2bit: Update to 0.3.0.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: cutadapt: Update to 1.18.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: Add python-dnaio.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: crossmap: Update to 0.2.9.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: python-twobitreader: Update to 3.1.6.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: Add python-bx-python.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: python2-bx-python: Update to 0.8.2.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: bwa-pssm: Fetch from git.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: tophat: Update to 2.1.1.
Ricardo Wurmus
2018-10-21
*
gnu: python2-dendropy: Disable failing test.
Ben Woodcroft
2018-10-21
*
gnu: bowtie: Update to 2.3.4.3.
Ricardo Wurmus
2018-10-20
*
gnu: blast+: Use INVOKE and return #T unconditionally.
Ricardo Wurmus
2018-10-20
*
gnu: bedops: Update to 2.4.35.
Ricardo Wurmus
2018-10-20
*
gnu: bedops: Use INVOKE.
Ricardo Wurmus
2018-10-20
*
gnu: bamm: Fetch from git and use INVOKE.
Ricardo Wurmus
2018-10-20
*
gnu: aragorn: Use invoke and simplify.
Ricardo Wurmus
2018-10-20
*
gnu: clipper: Update to 1.2.1.
Ricardo Wurmus
2018-10-20
*
gnu: python-pybedtools: Update to 0.7.10.
Ricardo Wurmus
2018-10-20
*
gnu: Add bedtools-2.26.
Ricardo Wurmus
2018-10-20
*
gnu: kallisto: Update to 0.44.0.
Ricardo Wurmus
2018-10-11
*
gnu: Add filtlong.
pimi
2018-10-08
*
gnu: Add ngless.
Ricardo Wurmus
2018-10-05
*
gnu: bioruby: Update to 1.5.2.
Christopher Baines
2018-10-05
*
gnu: samtools-0.1: Adjust to match changes in samtools.
Ricardo Wurmus
2018-10-05
*
gnu: deeptools: Update to 3.1.2.
Ricardo Wurmus
2018-10-05
*
gnu: python-pysam: Update to 0.15.1.
Ricardo Wurmus
2018-10-05
*
gnu: bcftools: Update to 1.9.
Ricardo Wurmus
2018-10-05
*
gnu: samtools: Update to 1.9.
Ricardo Wurmus
2018-10-05
*
gnu: htslib: Update to 1.9.
Ricardo Wurmus
2018-10-05
*
gnu: Add r-absfiltergsea.
pimi
2018-10-02
*
gnu: Add poretools.
pimi
2018-10-02
*
gnu: Add porechop.
pimi
2018-09-30
*
gnu: Add r-bseqsc.
Ricardo Wurmus
2018-09-24
*
gnu: Add r-cssam.
Ricardo Wurmus
2018-09-24
*
gnu: Add r-xbioc.
Ricardo Wurmus
2018-09-24
*
gnu: hmmer: Update to 3.2.1.
Ben Woodcroft
2018-09-22
*
gnu: Add r-pore.
pimi
2018-09-21
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