index
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gds/gnu-guix
guix-for-govuk-mini-environment-admin
release
release_2
spike-end-to-end-test-system
spike-local-development-system-container
wip-postgresql-ssl
This repository contains snapshots of GNU Guix, to be used by the govuk-guix project.
Gitolite user
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log
tree
commit
diff
log msg
author
committer
range
path:
root
/
gnu
/
packages
/
bioinformatics.scm
Commit message (
Expand
)
Author
Age
*
gnu: diamond: Update to 0.9.16.
Ben Woodcroft
2018-01-27
*
gnu: diamond: Update to 0.9.15.
Ben Woodcroft
2018-01-26
*
gnu: deeptools: Update URI.
Tobias Geerinckx-Rice
2018-01-26
*
gnu: star: Make reproducible.
Ricardo Wurmus
2018-01-22
*
gnu: khmer: Add aarch64-linux to supported systems.
Efraim Flashner
2018-01-22
*
gnu: Add salmon.
Ricardo Wurmus
2018-01-21
*
gnu: Add sailfish.
Ricardo Wurmus
2018-01-21
*
gnu: Add libdivsufsort.
Ricardo Wurmus
2018-01-21
*
gnu: Add libgff.
Ricardo Wurmus
2018-01-21
*
gnu: seqmagick: Use 'pypi-uri'.
Ben Woodcroft
2018-01-10
*
gnu: mafft: Update to 7.313.
Ben Woodcroft
2018-01-10
*
gnu: seqmagick: Update to 0.7.0.
Ben Woodcroft
2018-01-09
*
gnu: htslib: Mark up description.
Tobias Geerinckx-Rice
2018-01-02
*
gnu: ribotaper: Wrap executables.
Ricardo Wurmus
2018-01-02
*
gnu: python-pysam: Update to 0.13.0.
Tobias Geerinckx-Rice
2018-01-02
*
gnu: htslib: Update to 1.6.
Tobias Geerinckx-Rice
2018-01-02
*
gnu: vsearch: Update to 2.6.2.
Ben Woodcroft
2017-12-27
*
gnu, doc: Use HTTPS for cran.r-project.org home pages.
Tobias Geerinckx-Rice
2017-12-24
*
gnu: Update r-mutationalpatterns to 1.4.2.
Roel Janssen
2017-12-22
*
gnu: r-biomart: Update to 2.34.1.
Ricardo Wurmus
2017-12-19
*
gnu: r-gviz: Update to 1.22.2.
Ricardo Wurmus
2017-12-19
*
gnu: r-gqtlstats: Update to 1.10.1.
Ricardo Wurmus
2017-12-19
*
gnu: r-rtracklayer: Update to 1.38.2.
Ricardo Wurmus
2017-12-19
*
gnu: r-limma: Update to 3.34.4.
Ricardo Wurmus
2017-12-19
*
gnu: r-edger: Update to 3.20.2.
Ricardo Wurmus
2017-12-19
*
gnu: r-biocstyle: Update to 2.6.1.
Ricardo Wurmus
2017-12-19
*
gnu: r-dexseq: Update to 1.24.2.
Ricardo Wurmus
2017-12-19
*
gnu: r-vegan: Update to 2.4-5.
Ricardo Wurmus
2017-12-19
*
gnu: r-seurat: Update to 2.1.0.
Ricardo Wurmus
2017-12-18
*
gnu: r-seurat: Fix ModularityOptimizer.jar.
Ricardo Wurmus
2017-12-18
*
gnu: bedtools: Update to 2.27.1.
Ben Woodcroft
2017-12-15
*
gnu: diamond: Update to 0.9.14.
Ben Woodcroft
2017-12-14
*
gnu: Switch to using the version-major procedure.
Christopher Baines
2017-12-11
*
gnu: bedtools-2.18: Fix build.
Ricardo Wurmus
2017-12-09
*
gnu: bedtools: Update to 2.27.0.
Ricardo Wurmus
2017-12-06
*
gnu: Add kallisto.
Ricardo Wurmus
2017-12-03
*
gnu: jellyfish: Update to 2.2.7.
Ricardo Wurmus
2017-11-30
*
gnu: r-annotationhub: Update to 2.10.1.
Ricardo Wurmus
2017-11-30
*
gnu: r-msnid: Update to 1.12.1.
Ricardo Wurmus
2017-11-30
*
gnu: r-maldiquant: Update to 1.17.
Ricardo Wurmus
2017-11-30
*
gnu: r-genomicalignments: Update to 1.14.1.
Ricardo Wurmus
2017-11-30
*
gnu: r-limma: Update to 3.34.2.
Ricardo Wurmus
2017-11-30
*
gnu: r-variantannotation: Update to 1.24.2.
Ricardo Wurmus
2017-11-30
*
gnu: r-getopt: Update to 1.20.1.
Ricardo Wurmus
2017-11-30
*
gnu: r-gseabase: Update to 1.40.1.
Ricardo Wurmus
2017-11-30
*
gnu: r-dexseq: Update to 1.24.1.
Ricardo Wurmus
2017-11-30
*
gnu: r-deseq2: Update to 1.18.1.
Ricardo Wurmus
2017-11-30
*
gnu: r-annotate: Update to 1.56.1.
Ricardo Wurmus
2017-11-30
*
gnu: metabat: Use scons-build-system.
Arun Isaac
2017-11-30
*
gnu: Update r-mutationalpatterns to 1.4.1.
Roel Janssen
2017-11-29
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