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* gnu: vsearch: Fetch source from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: preseq: Update to 2.0.3.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: preseq: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: seqtk: Update to 1.3.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: seqtk: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: raxml: Update to 8.2.12.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: python2-biom-format: Fix build.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: raxml: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: pyicoteo: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: hplip: Remove bundled non-free blobs.Efraim Flashner2018-11-07
* pull: Add missing monadic 'return'.Ludovic Courtès2018-11-07
* gnu: sra-tools: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: libgff: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: kentutils: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: r-seqgl: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: pplacer: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: minced: Update to 0.3.2.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: minced: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: metabat: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: mash: Update to 2.1.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: mash: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: fio: Update to 3.11.Marius Bakke2018-11-07
* gnu: kaiju: Update to 1.6.3.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: kaiju: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: idr: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: java-htsjdk: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: hisat2: Use versioned source URL.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: grit: Update to 2.0.5.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: grit: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: gemma: Update to 0.98.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: gemma: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: clementine: Build with sqlite-with-column-metadata.Pierre Langlois2018-11-07
* gnu: fxtract: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: ribodiff: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: python-biom-format: Update to 2.1.7.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: python-biom-format: Fetch source from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: bioawk: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: bedtools-2.18: Fetch sources from stable URL.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: bamtools: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: ngless: Install links to required tools.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: prodigal: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-07
* services: cuirass: Add 'ttl' configuration field.Ludovic Courtès2018-11-07
* gnu: cuirass: Update to 0b40dca.Ludovic Courtès2018-11-07
* linux-initrd: Make sure 'build-initrd' can delete files.Ludovic Courtès2018-11-07
* gnu: r-mzr: Update to 2.16.0.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: r-rhdf5lib: Update to 1.4.0.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: r-hdf5array: Update to 1.10.0.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: r-rhdf5: Update to 2.26.0.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: r-rcas: Update to 1.8.0.Ricardo Wurmus2018-11-07
* gnu: r-delayedmatrixstats: Update to 1.4.0.Ricardo Wurmus2018-11-07